Update to 2.13. 50/4750/1
authorJim Phillips <jim@ks.uiuc.edu>
Mon, 29 Oct 2018 21:05:56 +0000 (16:05 -0500)
committerJim Phillips <jim@ks.uiuc.edu>
Mon, 29 Oct 2018 21:05:56 +0000 (16:05 -0500)
Change-Id: I378e27ec1917ebe82e860e3da4398cc4bc4494ba

Makefile
announce.txt
notes.txt
ug/Makefile

index de0f30b..bfbcdb6 100644 (file)
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -1,5 +1,5 @@
 # pass version/platform information to compile
-NAMD_VERSION = 2.13b2
+NAMD_VERSION = 2.13
 
 # compiler flags (Win32 overrides)
 COPTI = -I
index ba22880..1272bad 100644 (file)
@@ -1,10 +1,10 @@
 +--------------------------------------------------------------------+
 |                                                                    |
-|                  NAMD 2.13b2 Release Announcement                  |
+|                   NAMD 2.13 Release Announcement                   |
 |                                                                    |
 +--------------------------------------------------------------------+
 
-                                                      October 16, 2018
+                                                      November 1, 2018
 
 The Theoretical and Computational Biophysics Group at the University of
 Illinois is proud to announce the public release of a new version of
@@ -13,7 +13,7 @@ high-performance simulation of large biomolecular systems.  NAMD is
 distributed free of charge and includes source code.  NAMD development
 is supported by the NIH National Institute of General Medical Sciences.
 
-NAMD 2.13b2 has many advantages over NAMD 2.12, including:
+NAMD 2.13 has many advantages over NAMD 2.12, including:
 
 - GPU-accelerated simulations less limited by CPU performance
 
index 6f4c9d5..9f62528 100644 (file)
--- a/notes.txt
+++ b/notes.txt
@@ -1,6 +1,6 @@
 +--------------------------------------------------------------------+
 |                                                                    |
-|                     NAMD 2.13b2 Release Notes                      |
+|                      NAMD 2.13 Release Notes                       |
 |                                                                    |
 +--------------------------------------------------------------------+
 
@@ -574,8 +574,8 @@ to set the path to TCL and FFTW libraries correctly.
 As an example, here is the build sequence for 64-bit Linux workstations:
 
 Unpack NAMD and matching Charm++ source code:
-  tar xzf NAMD_2.13b2_Source.tar.gz
-  cd NAMD_2.13b2_Source
+  tar xzf NAMD_2.13_Source.tar.gz
+  cd NAMD_2.13_Source
   tar xf charm-6.8.2.tar
 
 Build and test the Charm++/Converse library (single-node multicore version):
@@ -611,7 +611,7 @@ Build and test the Charm++/Converse library (MPI version):
   cd ../../../../..
 
 Download and install TCL and FFTW libraries:
-  (cd to NAMD_2.13b2_Source if you're not already there)
+  (cd to NAMD_2.13_Source if you're not already there)
   wget http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/libraries/fftw-linux-x86_64.tar.gz
   tar xzf fftw-linux-x86_64.tar.gz
   mv linux-x86_64 fftw
@@ -623,7 +623,7 @@ Download and install TCL and FFTW libraries:
   mv tcl8.5.9-linux-x86_64-threaded tcl-threaded
 
 Optionally edit various configuration files:
-  (not needed if charm-6.8.2, fftw, and tcl are in NAMD_2.13b2_Source)
+  (not needed if charm-6.8.2, fftw, and tcl are in NAMD_2.13_Source)
   vi Make.charm  (set CHARMBASE to full path to charm)
   vi arch/Linux-x86_64.fftw     (fix library name and path to files)
   vi arch/Linux-x86_64.tcl      (fix library version and path to TCL files)
index a4b352a..1140c55 100644 (file)
@@ -1,7 +1,7 @@
 #####
 # define version
 #####
-NAMD_VERSION = 2.13b2
+NAMD_VERSION = 2.13
 
 #####
 # specific names of programs used in make commands